Trouble with file io

Hi, I am new to c++ (and programming in general) and have a problem with a small project that I am doing to aid my research. I run multiple Polymerase Chain Reactions to amplify specific sections of DNA from pathogenic bacteria. Anyway, to take some of the pain out of setting these up, I read up a bit and wrote a small c++ programme to calculate the volumes I need for single and multiple PCR reactions. The programme works fine but I would like to add the ability to save the output from my programme to a file. Specifically I would like the programme to invoke the user to name an output file and then for the programme to write to that file and to close the file. I have tried using examples of file io from this site and others but i do not have enough experience or knowledge to implement them properly. I have included the code below. Would anyone be able to point me in the direction of a tutorial that could help me with this, or suggest some additions to my code? The programme was written using emacs on a Mac running mac os 10.2.5 and compiled using g++.

Thanks in advance

will

Code:

---

// Mastermix Version 0.4
// April 2003
// William Gordon MacKay
// E-mail - wgmk1d@udcf.gla.ac.uk

#include <iostream.h>

using namespace std;

int main ()

        {
                cout << endl << endl;
                cout << "MASTERMIX (version 0.4 [23.04.2003])" << endl << endl;
                cout << "WG MacKay (wgmk1d@udcf.gla.ac.uk)" << endl << endl;
                cout << "Please enter the volumes for one PCR (in microlitres) below," << endl << endl;
               
                // Defines the PCR reagent variables and prompt the user to asign them values
                // These PCR reagent variables are then asigned names and printed to the terminal

                int ReturnCode = 0;
               
                float pcr = 1;
                cout << "Total vol:        ";
                cin >> pcr;
               
                if (!cin.fail()) // numerical value entered
                {
                        float pcrB = 1;
                        cout << "Buffer:                ";
                        cin >> pcrB;
               
                if (!cin.fail()) // numerical value entered
                {
                        float pcrM = 1;
                        cout << "MgCl2:                ";
                        cin >> pcrM;
               
                if (!cin.fail()) // numerical value entered
                {
                        float pcrD = 1;
                        cout << "dNTPs:                ";
                        cin >> pcrD;
               
                if (!cin.fail()) // numerical value entered
                {
                        float pcrF = 1;
                        cout << "Forward:        ";
                        cin >> pcrF;
               
                if (!cin.fail()) // numerical value entered
                {
                        float pcrR = 1;
                        cout << "Reverse:        ";
                        cin >> pcrR;
               
                if (!cin.fail()) // numerical value entered
                {
                        float pcrU = 1;
                        cout << "Undefined:        ";
                        cin >> pcrU;
               
                if (!cin.fail()) // numerical value entered
                {
                        float pcrT = 1;
                        cout << "Taq:                ";
                        cin >> pcrT;
                                                                       
                if (!cin.fail()) // numerical value entered
                {
                        float pcrA = 1;
                        cout << "Target:                ";
                        cin >> pcrA;
               
                if (!cin.fail()) // numerical value entered
                {                               
                        // The variable water is a special case and is calculated as the "Total volume" - all other volumes
                        float Water = (pcr-(pcrB+pcrM+pcrD+pcrF+pcrR+pcrT+pcrU+pcrA));
                        cout << "Water:                " << Water << endl << endl;
               
                        // Defines the "number of reactions" variable and prompt the use to asign it a value.               
               
                        float Nr = 1;
                        cout << "Enter number of PCR reactions (+1 to account for pipetting error): ";
                        cin >> Nr;
                        cout << endl;
                       
                                // New variables are defined that are then multiplied by the "number of reactions"
                                // variable and the corresponding PCR variable.
                                // This produces the PCR reagent variable values for a "PCR mastermix".
                       
                                float Tpcr = Nr*pcr;
                                float TpcrB = Nr*pcrB;
                                float TpcrM = Nr*pcrM;
                                float TpcrD = Nr*pcrD;
                                float TpcrF = Nr*pcrF;
                                float TpcrR = Nr*pcrR;
                                float TpcrT = Nr*pcrT;
                                float TpcrA = Nr*pcrA;
                                float TWater = Nr*Water;
                               
                                        // The orginal PCR reagent variables and the new variables (multiplied by the "number of reactions" variable.
                                        // This produces a list of PCR reagents and their corresponding volumes (in microlitres)
                                        // for a single PCR reaction and a PCR reaction mastermix
                                                                                       
                                        cout << endl;
                                        cout << "Calculating mastermix..." << endl << endl;
                                        cout << "PCR x" << Nr << endl << endl;
                                        cout << "Water:                " << TWater << endl;
                                        cout << "10X:                " << TpcrB << endl;
                                        cout << "MgCl2:                " << TpcrM << endl;
                                        cout << "dNTPS:                " << TpcrD << endl;
                                        cout << "Forward:        " << TpcrF << endl;
                                        cout << "Reverse:        " << TpcrR << endl;
                                        cout << "Taq:                " << TpcrT << endl;                                               
                                        cout << "Total Vol:        " << Tpcr << endl;
                                        cout << endl << endl;
                }
                else
                {
                        cerr << "ERROR - invalid input" << endl;
               
                        cin.clear(); // Clear bad input
                        char BadInput[5]; // Clear up to 5 characters
                        cin >> BadInput;
               
                        ReturnCode = 1;
                        };
                }
                else
                {
                        cerr << "ERROR - invalid input" << endl;
                       
                        cin.clear(); // Clear bad input
                        char BadInput[5]; // Clear up to 5 characters
                        cin >> BadInput;
               
                        ReturnCode = 1;
                        };
                }
                else
                {
                        cerr << "ERROR - invalid input" << endl;
                                       
                        cin.clear(); // Clear bad input
                        char BadInput[5]; // Clear up to 5 characters
                        cin >> BadInput;
               
                        ReturnCode = 1;
                        };               
                }
                else
                {
                        cerr << "ERROR - invalid input" << endl;
               
                        cin.clear(); // Clear bad input
                        char BadInput[5]; // Clear up to 5 characters
                        cin >> BadInput;
               
                        ReturnCode = 1;
                        };               
                }
                else
                {
                        cerr << "ERROR - invalid input" << endl;
                                               
                        cin.clear(); // Clear bad input
                        char BadInput[5]; // Clear up to 5 characters
                        cin >> BadInput;

                        ReturnCode = 1;
                        };               
                }
                else
                {
                        cerr << "ERROR - invalid input" << endl;
               
                        cin.clear(); // Clear bad input
                        char BadInput[5]; // Clear up to 5 characters
                        cin >> BadInput;
               
                        ReturnCode = 1;
                        };
                }
                else
                {
                        cerr << "ERROR - invalid input" << endl;
               
                        cin.clear(); // Clear bad input
                        char BadInput[5]; // Clear up to 5 characters
                        cin >> BadInput;
       
                        ReturnCode = 1;
                        };
                }
                else
                {
                        cerr << "ERROR - invalid input" << endl;
               
                        cin.clear(); // Clear bad input
                        char BadInput[5]; // Clear up to 5 characters
                        cin >> BadInput;
       
                        ReturnCode = 1;
                        };
                }
                else
                {
                        cerr << "ERROR - invalid input" << endl;       
               
                        cin.clear(); // Clear bad input
                        char BadInput[5]; // Clear up to 5 characters
                        cin >> BadInput;
               
                        ReturnCode = 1;
                };
               
        cout << "Goodluck" << endl << endl;
       
        return 0;
}

---

Code:

---

#include <fstream>//for fstream objects
#include <iostream>

using namespace std;

int main()
{
        char filename[50];
        cout<<"Enter a file name for output "
            <<"(e.g. C:\\MyFolder\\my_file.text):"<<endl;

        cin.getline(filename, 50);


        fstream output_file(filename);
      //associates the file with an fstream object and opens the file
        int calculation=4*50 + 2;
        output_file<<calculation;

        output_file.close();

        return 0;
}

---

Example of execution:

Enter a file name for output (e.g. C:\MyFolder\my_file.text):
C:\TestData\output.txt
Press any key to continue

output.txt
----------
202


P.S. Do you think this was in any way helpful in explaining that you don't know how to do file I/O:

I run multiple Polymerase Chain Reactions to amplify specific sections of DNA from pathogenic bacteria

7stud said,

"P.S. Do you think this was in any way helpful in explaining that you don't know how to do file I/O:

I run multiple Polymerase Chain Reactions to amplify specific sections of DNA from pathogenic bacteria"

I thought I was being polite by puting the code in context. Apologies.

Thanks for the advice

will;)